一、阜阳农村合作医疗在哪里报销
农村合作医疗如果是住院，那么只要携带报销所需的资料，就可以去医院新农合窗口进行审核并报销。如果医院没有相关的报销窗口，那么出院以后需要去区行政服务中心新农合窗口报销医药费用。而外地就医的话，定点医院可以直接在医院进行报销，医院不能直接报销的话，需要回户籍所在地的卫生院报销。
二、报销的流程
1、新农合参保患者可以凭本人身份证、医保卡，在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构可直接刷卡报销，在区内及区外市内定点医疗机构住院，出院结帐时直接刷卡报销。
2、在市外二级及二级以上的公立医疗机构医院住院治疗的参保患者，应在出院后的3个月后，携带医药费原始发票、住院医药费用汇总明细清单、出院小结、医疗卡、户口本、门诊病历、经办人身份证直接到新农合窗口报销医药费用。
3、特殊病种门诊报销，参保患者可持二级及二级以上定点医疗机构出具的病历及相关检查报告资料以及《新农合特殊病种门诊治疗审批表》向新农合业管中心提出申请，经过审核批准之后，其门诊医药费用是可以列入到新农合的报销范围内的。
4、因意外伤害住院的话只能出院后提交意外伤害引发的原因证明和医院的病案记录。对于一些无法提供有效证明和记录的，不予进行受理。报销参保患者将资料提交之后，新农合窗口受理后的30个工作日内完成。不过，需要经过新农合业管中心稽查人员的调查和审核，情况属实之后才能予以报销。