依据我国相关法律的规定，房屋拆迁中停产停业损失的补偿，根据房屋被征收前的效益、停产停业期限等因素确定的。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》
第十七条 作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
(一)被征收房屋价值的补偿;
(二)因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿;
(三)因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。
第二十三条 对因征收房屋造成停产停业损失的补偿，根据房屋被征收前的效益、停产停业期限等因素确定。具体办法由省、自治区、直辖市制定。
实践中，被征收人在收到评估报告时，会对评估报告的评估结果、评估程序等问题产生异议，针对评估报告有异议的，可以通过以下几种方式来维护自身合法权益。
1、公示期间可以修正。第一步是分户初步评估结果在公示期间，当被征收人对评估报告有疑问时，出具报告的评估机构有义务作出解释说明与修正。
2、10日内申请复核。如果你对评估结果有异议，可以从收到评估报告之日起10内向评估机构申请复核评估。
3、向专家委员会申请鉴定。如果被征收人对评估机构作出的复核仍有异议，这时应该在收到复核回复函之日起10日内，向被征收房屋所在地评估专家委员会申请鉴定。
4、复议或诉讼。如果经过复核和专家鉴定，被征收人对房屋价值的评估仍有异议，这时房屋征收部门会报请作出房屋征收决定的市、县级人民政府，政府会按照征收补偿方案作出补偿决定。被征收人此时可以针对该补偿决定申请行政复议，也可以提起行政诉讼。
因此，当评估机构出具的评估报告中有明显与事实不符或存在违法之处时，应及时提出异议。通过修正、复核、申请鉴定、协商订立协议、复议或诉讼的步骤，来维护自己的合法权益。