依据我国相关法律的规定，商标转让申请经商标管理部门批准后，会予以公告，受让人自公告之日起享有商标专用权，商标转让行为生效。
《中华人民共和国商标法》
第四十二条 转让注册商标的，转让人和受让人应当签订转让协议，并共同向商标局提出申请。受让人应当保证使用该注册商标的商品质量。
转让注册商标的，商标注册人对其在同一种商品上注册的近似的商标，或者在类似商品上注册的相同或者近似的商标，应当一并转让。
对容易导致混淆或者有其他不良影响的转让，商标局不予核准，书面通知申请人并说明理由。
转让注册商标经核准后，予以公告。受让人自公告之日起享有商标专用权。
1、关于商标转让中属于企业内部自身问题所造成的纠纷属于民事法律纠纷的范畴，一般情况下需要当事人自己通过司法诉讼程序来予以，来解决维护自己的权益。而商标局作为行政主管部门，一般不会介入。但是，如果该商标的转让申请还处在商标局转让审查进程中的，为了便于当事人主张自己的权利，对于这类商标转让纠纷，商标局会给于当事人一个合理的时限，当事人应该尽快通过司法诉讼来主张权利，超过该时限，商标局仍然会继续进行相应的正常商标转让审查程序。一旦商标转让申请被商标局核准公告后，则该商标转让行为已经事实产生法律效力。涉及到法律权限问题，当事人只能通过法院的申请证据保全措施来暂时冻结该商标转让后的权利实施，并通过诉讼书程序来解决相关商标转让纠纷。
2、对于假冒、伪造的商标非法转让问题，则需要通过当地的公安部门以伪造印章、文书，非法侵占财产等进行刑事鉴定，然后通过司法程序解决。
3、对于商标局作出的“不予受理”、“不予核准”等等行政决定的行政纠纷，可以向国家工商总局进行反映或者行政复议，或者行政诉讼等途径解决。