依据我国相关法律的规定，因劳动合同产生争议的，劳动者可以与用人单位协商处理，协商达成一致的，签订和解协议书，按协议书的约定处理。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》
第二条 中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：
(一)因确认劳动关系发生的争议;
(二)因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议;
(三)因除名、辞退和辞职、离职发生的争议;
(四)因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议;
(五)因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议;
(六)法律、法规规定的其他劳动争议。
第四条 发生劳动争议，劳动者可以与用人单位协商，也可以请工会或者第三方共同与用人单位协商，达成和解协议。
第五条 发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解;不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁;对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
公司要跟劳动者签订违约金条款，那是可以的，但并不是所有的条款都可以约定违约金。现在有些不正规的公司，经常在劳动合同中设立一些名头，要求员工支付违约金，严重损害劳动者的利益。事实上，公司只能在下面情况中可以要求支付违约金：
1、在培训服务期约定
公司为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与劳动者订立协议，约定服务期。
2、在竞业限制中约定
公司与劳动者可以在劳动合同中约定保守公司的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对负有保密义务的劳动者，公司可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。
所以，除了上面这两项之外，其他情况都不可以跟劳动者约定违约金。
而且，约定违约金时，违约金的数额不得超过公司提供的培训费用。公司要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
当然，要是在约定的时候发现公司说的违约金过高的话，劳动者可以去法院请求降低，通常规定是高不得超过所遭受损失30%，超过30%的法院会以实际损失为基础，兼顾合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等综合因素，根据公平原则和诚实信用原则予以衡量，并作出裁决。