网上办理流程
1.申请。申请人登录广东省网上办事大厅肇庆分厅提出申请，上传电子材料。
2.受理。接收受理人员对材料进行预审，在2个工作日之内提出预审意见，作出受理决定。申请人符合申请资格，且材料齐全、格式规范、符合法定形式的，予以受理，出具电子版《受理回执》；申请人不符合申请资格或材料不齐全、不符合法定形式的，接件受理人员不予受理，出具《不予受理通知书》。
3.审查。受理后，审查人员对材料进行审查，在20个工作日内作出审查决定。符合审批条件的，出具《广东省食品小作坊登记证》；不予通过的，出具《不予许可决定书》。审查过程，发现材料需补正的2个工作日内向申请人提出补正要求，出具《申请材料补正告知书》，申请人按要求补正后重新受理审查。
4.领取结果。申请人按约定的方式到市行政服务中心取证窗口或各所服务窗口领取《广东省食品小作坊登记证》或《不予许可决定书》。
窗口办理流程
食品小作坊登记证有效期为三年，有效期届满三十日前向所在地食品药品监督管理部门提出延续申请；逾期提出延续申请的，按照新申请食品小作坊登记证办理。
食品药品监督管理部门应当根据申请，在食品小作坊登记证有效期届满前作出是否准予延续的决定；逾期未作决定的，视为准予延续。
准予延续的，食品小作坊登记证有效期自批准之日起重新计算，证书编号不变。不予延续的，应以书面形式说明理由，并告知申请人享有依法申请行政复议或者提起行政诉讼的权利。