依据最新修订的关于民事诉讼证据的若干规定，人民法院在确定鉴定人后应当出具委托书，委托书中应当载明鉴定事项、鉴定范围、鉴定目的和鉴定期限。
《关于民事诉讼证据的若干规定》本规定自2020年5月1日起施行
第三十二条 人民法院准许鉴定申请的，应当组织双方当事人协商确定具备相应资格的鉴定人。当事人协商不成的，由人民法院指定。
人民法院依职权委托鉴定的，可以在询问当事人的意见后，指定具备相应资格的鉴定人。
人民法院在确定鉴定人后应当出具委托书，委托书中应当载明鉴定事项、鉴定范围、鉴定目的和鉴定期限。
一方当事人自行委托有关部门作出的鉴定结论，另一方当事人有证据足以反驳并申请重新鉴定的，人民法院应予准许。
由此可以看出，一方当事人自行委托有关部门依法作鉴定，法律并没有禁止，程序不违法。那一方当事人自行委托有关部门做的鉴定结论，必须是申请方有足够的证据足以反驳一方当事人自行委托有关部门做出的鉴定结论，包括程序违法、鉴定人员及机构无资质等问题，否则法院不应准许，以免浪费时间，影响审判效率，浪费诉讼资源。
当然，一方当事人自行委托有关部门作鉴定的，一般通过律师事务所进行委托，自己委托的，鉴定机构一般不接受，就算接受，做出来的鉴定也会因程序不合规定而成为其他诉讼参与人申请重新鉴定的理由。