依据我国相关法律的规定，双方当事人达成执行和解协议的，由于法院中止案件的执行，是不用交纳执行费用的，申请费用负担由双方协商解决，协商不成的，由法院决定。
《中华人民共和国诉讼费用交纳办法》
第三十八条 本办法第十条第(一)项、第(八)项规定的申请费由被执行人负担。
执行中当事人达成和解协议的，申请费的负担由双方当事人协商解决;协商不成的，由人民法院决定。
本办法第十条第(二)项规定的申请费由申请人负担，申请人提起诉讼的，可以将该申请费列入诉讼请求。
本办法第十条第(五)项规定的申请费，由人民法院依照本办法第二十九条规定决定申请费的负担。
当事人应当向人民法院交纳的诉讼费用包括三部分内容：案件受理费;申请费;证人、鉴定人、翻译人员、理算人员在人民法院指定日期出庭发生的交通费、住宿费、生活费和误工补贴。
1、案件受理费。含第一审案件受理费、第二审案件受理费、部分再审案件受理费。需要交纳案件受理费的再审案件包括：当事人有新的证据，足以推翻原判决、裁定，向法院申请再审，法院经审查决定再审的案件;当事人对法院第一审判决或者裁定未提出上诉，第一审判决、裁定或者调解书发生法律效力后又申请再审，法院经审查决定再审的案件。
根据《诉讼费用交纳办法》规定，下列四种案件不交纳案件受理费：(1)依照民事诉讼法规定的特别程序审理的案件;(2)裁定不予受理、驳回起诉、驳回上诉的案件;(3)对不予受理、驳回起诉和管辖权异议裁定不服，提起上诉的案件;(4)行政赔偿案件。
减半交纳案件受理费的情形包括：以调解方式结案或者当事人申请撤诉的;适用简易程序审理的;被告提起反诉，有独立请求权的第三人提出与本案有关的诉讼请求，法院决定合并审理的，分别减半交纳。
2、申请费。当事人依法向法院申请下列事项，应当交纳申请费：(1)申请执行法院发生法律效力的判决、裁定、调解书，仲裁机构依法作出的裁决和调解书，公证机构依法赋予强制执行效力的债权文书;(2)申请保全措施;(3)申请支付令;(4)申请公示催告;(5)申请撤销仲裁裁决或者认定仲裁协议效力;(6)申请破产;(7)申请海事强制令、共同海损、设立海事赔偿责任限制基金、海事债权登记、船舶优先权催告;(8)申请承认和执行外国法院判决、裁定和国外仲裁机构裁决。
3、证人、鉴定人、翻译人员、理算人员在法院指定日期出庭发生的交通费、住宿费、生活费和误工补贴。本项费用由法院按照国家规定标准代为收取。当事人复制案件卷宗材料和法律文书应当按实际成本向法院交纳工本费。