网上办理流程
1.网上申请。申请人向区畜牧兽医股提出申请，提交申请材料。
2.网上受理。接件受理人员核验申请材料，2个工作日作出受理决定。申请人符合申请资格，并材料齐全、格式规范、符合法定形式的，予以受理，出具《受理回执》；申请人不符合申请资格或材料不齐全、不符合法定形式的，接件受理人员不予受理，出具《不予受理通知书》。 申请人材料不符合要求但可以当场更正的，退回当场更正后予以受理。
3.网上审查。受理后，登记机关对材料进行审查，在5个工作日内提出审查意见，作出审查决定。符合审批条件的，出具相应核定证书（部门最终结果文书）；不予通过的，出具《不予许可决定书》。审查过程，发现材料需补正的2个工作日内向申请人提出补正要求，出具《申请材料补正告知书》，申请人按要求补正后重新受理审查。
4.领取结果。申请人按约定的方式到畜牧兽医股窗口领取相关证书。
窗口办理流程
1.申请。申请人向畜牧兽医水产局畜牧股窗口提出申请，提交申请材料。
2.受理。接件受理人员核验申请材料，在2日内作出受理决定。申请人符合申请资格，并材料齐全、格式规范、符合法定形式的，予以受理；申请人不符合申请资格或材料不齐全、不符合法定形式的，接件受理人员不予受理，出具《不予受理通知书》。 申请人材料不符合要求但可以当场更正的，退回当场更正后予以受理。
3.审查。受理后，组织专家对材料进行审查及对养殖企业进行现场审核，在20个工作日内作出决定。符合审批条件的，出具《种畜禽生产经营许可证》；如审核决定不予发放，应将不予发放的原因书面告知申请人。
4.领取结果。申请人按约定的方式到畜牧兽医水产局畜牧股窗口领取办理结果。