犯本罪的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处二万元以上二十万元以下罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下的罚金。
单位犯擅自设立金融机构罪的，对单位判处罚金，并对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依上述对个人犯罪的规定处罚。