适用本罪时应区分组织越狱罪与脱逃罪的界限。本罪与脱逃罪在形式上都表现为在押的犯罪分子逃离监管、羁押场所。两者的区别是：
1、行为方式不同。本罪在客观方面表现为有计划、有组织地进行，并且一般是使用暴力手段，公开与国家专政机关对抗;而脱逃罪在客观方面往往采取秘密逃跑的方式。
2、本罪是多数在押犯勾结在一起，在首要分子的指挥、策划下，有组织、有计划地集体逃跑越狱的行为。而脱逃罪一般只是个别犯罪分子单独的逃跑行为。
371条二款是暴动越狱罪，不要把其现解为组织越狱的加重情况，在组织越狱中个别人没有打算使用集体的暴力，但由于个别人受到别人的阻碍而使用了暴力，还不能认为是暴动越狱。