依据我国相关法律的规定，对已登记的土地承包经营权进行互换的，要申请土地承包经营权的转移登记，要提供互换协议等材料。
《中华人民共和国不动产登记条例实施细则》
第五十条 已经登记的土地承包经营权发生下列情形之一的，当事人双方应当持互换协议、转让合同等材料，申请土地承包经营权的转移登记：
(一)互换;
(二)转让;
(三)因家庭关系、婚姻关系变化等原因导致土地承包经营权分割或者合并的;
(四)依法导致土地承包经营权转移的其他情形。
以家庭承包方式取得的土地承包经营权，采取转让方式流转的，还应当提供发包方同意的材料。
土地承包经营权纠纷是指当事人间因承包土地的使用、收益、流转、调整、收回以及承包合同的履行等事项发生的争议。它既可能发生在承包土地的农民之间，也可能发生在承包土地的农民与农村集体经济组织或者自治组织之间，还可能发生在农民和其他单位或者个人之间。
因土地承包经营发生纠纷的，双方当事人可以通过协商解决，也可以请求村民委员会、乡(镇)人民政府等调节解决。当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。
对行政机关依据职权侵犯农村土地承包经营权的，还可以申请行政复议，对行政复议结果不服的，除法律规定的少数事项外，还可以向人民法院提起诉讼。
协商解决是指当事人再发生土地承包经营权纠纷后，在自愿互谅的基础上，直接进行磋商谈判，自行解决争议。调解是指在当事人自愿的基础上，由当事人双方同意的第三者从中进行沟通、斡旋，使纠纷当事人自行达成解决纠纷的办法。