一、总公司跑了分公司怎么注销
注销登记流程：
1、自做出注销决定之日起15日内成立清算组;
2、清算组自成立之日起10日内通知债权人，并于60日内在报纸上至少公告三次;
3、清偿分公司债务，到税务部门办理完税证明;
4、填写注销登记申请书，提交登记文件、证件，按约定日期领取核准通知书。
注销登记应提交的文件、证件：
1、分公司注销登记申请书;
2、股东会依照《公司法》作出的解散决定;
3、股东会确认的清算报告;
4、清算组织成立后60日内在报纸上公告三次的报样;
5、税务部门出具的完税证明;
6、营业执照正、副本。
二、公司注销后的民事主体资格
根据我国《公司法》规定，公司经过解散、清算、注销登记三项程序后即被注销，公司的法人资格和各种权利义务就归于消灭。经注销登记并公告后，公司终止。由于法人资格的丧失，注销后的公司就丧失了民事主体的地位，也失去了以公司名义行使各种权利的资格和能力。因此，如果公司注销后还有遗留的债权，因原公司已经不存在，也无法以公司的名义行使追索等权利了。