（一）申请人向国家移民管理局委托的县级以上公安机关出入境管理机构提交申请材料；
（二）受理机构对符合申请条件，申请材料齐全且符合法定形式的，向申请人出具受理回执；对申请材料不齐全或者不符合法定形式的，一次性告知申请人需要补正的全部内容；对不属于本部门职责范围或不符合受理要求的，不予受理，并向申请人说明理由。
（三）审批机构进行审核，作出批准或者不予批准的决定。批准的，签发证件；不予批准的，向申请人出具《不予批准决定书》。
（四）申请人领取证件。
（一）填写《台湾居民来往大陆通行证申请表》；
（二）提交符合《出入境证件相片照相指引》的照片；
（三）交验本人有效的台湾地区身份证和台湾地区出入境证件。没有身份证的，交验户籍誊本或户口名簿。有关证件交验原件，留存身份证或户籍誊本（户口名簿）的复印件或者电子扫描件。
父母双方为台湾居民，本人在大陆出生，已取得台湾地区入台许可的，应当交验申请人父母台胞证、本人出生证明。
在大陆停居留的台湾居民应当按照《中国公民往来台湾地区管理办法》的规定办理住宿登记后申请办理台胞证。