依据我国相关法律的规定，对农村四合院进行动迁的，补偿的项目包括土地补偿费，地上附着物及青苗补偿费，安置补偿等。
《中华人民共和国土地管理法实施条例》
第二十六条 土地补偿费归农村集体经济组织所有;地上附着物及青苗补偿费归地上附着物及青苗的所有者所有。
征用土地的安置补助费必须专款专用，不得挪作他用。需要安置的人员由农村集体经济组织安置的，安置补助费支付给农村集体经济组织，由农村集体经济组织管理和使用;由其他单位安置的，安置补助费支付给安置单位;不需要统一安置的，安置补助费发放给被安置人员个人或者征得被安置人员同意后用于支付被安置人员的保险费用。
市、县和乡(镇)人民政府应当加强对安置补助费使用情况的监督。
在实际中，一旦确定了房屋拆迁，就要明确拆迁补偿协议，并且协议内容应当具体、明确，否则的话，双方容易引起不必要的争执。
具体而言，拆迁补偿协议通常包括以下几点内容：
1、拆迁补偿的具体措施
实践中，拆迁补偿时可以是货币补偿，也可以是产权置换。用货币补偿的话，要明确补偿数额的计算，并确定最终的补偿款。
用产权置换的话，置换的位置和置换面积都要做出详细的约定，以免签了协议、把房子拆了之后，双方可能再出现纠纷。
2、拆迁补偿款的支付时间，或者是安置房交付的期限
按规定，“作出房屋征收决定前，征收补偿费用应当足额到位、专户存储、专款专用。”所以，拆迁方作出决定前，就要保证有足够的补偿金额，所以约定拆迁协议时，也能够确定补偿款的支付时间，以及安置房等的交付时间。
3、违约责任
一般地，签订拆迁补偿协议后，拆迁房到期交不了房子，或是拿不出补偿款，那么，被拆迁人即可以根据协议积极起诉维权。