依据我国相关法律的规定，员工在公司抽烟如果是严重违反公司制度的，是可以开除的，如果不是严重违反，就不能解除劳动合同。
《中华人民共和国劳动合同法》
第三十九条 劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
(一)在试用期间被证明不符合录用条件的;
(二)严重违反用人单位的规章制度的;
(三)严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的;
(四)劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的;
(五)因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的;
(六)被依法追究刑事责任的。
1、违反规章制度，是否严重，应当由用人单位来判断，但也应该符合本单位一般职工的判断。当然如果因为解除劳动合同引发的劳动争议，还应该接受劳动仲裁机构的审查。
2、《劳动合同法》第39条第2项规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。——重要前提是，用人单位的规章制度必须合法有效。表现在：
(1)规章制度的内容必须符合法律、法规的规定;
(2)规章制度必须通过民主程序制定，并且已经向劳动者公示。
只有符合这两个条件，用人单位才可依据规章制度解除劳动合同。结合上述，用人单位应当根据劳动法律法规所规定的限度和本单位的客观情况在规章制度中予以明确，并需要做到公平合理。
3、《劳动合同法》第4条规定：用人单位在制定、修改或者决定直接涉及劳动者切身利益的劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。直接涉及劳动者切身利益的规章制度应当公示，或者告知劳动者。
(1)单位制作的规章制度必须主体合法。最好是员工代表大会讨论通过，并且相应的工会也参与规章制度的制订;(2)单位必须依法制定明确具体的规章制度。即哪些纳入严重违反规章制度之中，哪些是一般性违反的规章制度;(3)单位必须将相关的规章制度书面告知劳动者或公示。