依据我国相关法律的规定，单位集资房是按经济适用住房管理的，只要拥有房屋的全部产权，并且住满五年的，就可以出售房屋。
《经济适用住房管理办法》
第三十条 经济适用住房购房人拥有有限产权。
购买经济适用住房不满5年，不得直接上市交易，购房人因特殊原因确需转让经济适用住房的，由政府按照原价格并考虑折旧和物价水平等因素进行回购。
购买经济适用住房满5年，购房人上市转让经济适用住房的，应按照届时同地段普通商品住房与经济适用住房差价的一定比例向政府交纳土地收益等相关价款，具体交纳比例由市、县人民政府确定，政府可优先回购;购房人也可以按照政府所定的标准向政府交纳土地收益等相关价款后，取得完全产权。
上述规定应在经济适用住房购买合同中予以载明，并明确相关违约责任。
第三十五条 单位集资合作建房是经济适用住房的组成部分，其建设标准、优惠政策、供应对象、产权关系等均按照经济适用住房的有关规定严格执行。单位集资合作建房应当纳入当地经济适用住房建设计划和用地计划管理。
1、房产再交易的限制。由于经济适用房所占土地是政府划拨地，购买者如果再次转让其房产，须就转让价格高于房产价值的部分向国家交纳土地收益金或者须在补交相关土地出让金后再将该房产连同土地使用权转让。而商品房的转让程序已经较为成熟。
2、房产出租的限制。由于经济适用房不享有出让性质的土地使用权，所以租金收益中，除按照有关规定缴纳相关税费外，还应向国家交纳土地收益金。商品房的租金收入，只须按国家规定交纳相关税费即可。
3、房产抵押的限制。由于经济适用房占地为国有划拨地，无法办理抵押登记手续。而商品房抵押登记程序是明确、顺畅的。
4、房产继承问题。我国尚没有关于经济适用房继承问题的法律、法规。商品房的继承不存在问题。
另外，需要提醒的是，按市场价格出售经济适用住房后不能再次购买经济适用住房和其他保障性质的住房。