依据我国相关法律的规定，上级行政部门是不能指定管辖的，就管辖权有异议的，由上级人民法院指定下级人民法院管辖。
《中华人民共和国行政诉讼法》
第二十二条 人民法院发现受理的案件不属于本院管辖的，应当移送有管辖权的人民法院，受移送的人民法院应当受理。受移送的人民法院认为受移送的案件按照规定不属于本院管辖的，应当报请上级人民法院指定管辖，不得再自行移送。
第二十三条 有管辖权的人民法院由于特殊原因不能行使管辖权的，由上级人民法院指定管辖。
人民法院对管辖权发生争议，由争议双方协商解决。协商不成的，报它们的共同上级人民法院指定管辖。
第二十四条 上级人民法院有权审理下级人民法院管辖的第一审行政案件。
下级人民法院对其管辖的第一审行政案件，认为需要由上级人民法院审理或者指定管辖的，可以报请上级人民法院决定。
1、当事人可以自由选择救济途径，可以申请复议，也可以提起诉讼，在选择复议后，对复议不服仍可以再起诉。公民、法人或其他组织既提起诉讼又申请复议的，由先受理的机关管辖。同时受理的由当事人选择。公民、法人或其他组织已经申请行政复议，在法定复议期间内又向人民法院起诉的，人民法院不予受理。公民、法人或其他组织向行政机关申请复议后，又经复议机关同意撤回复议申请的，在法定期限内对原具体行政行为提起诉讼的，人民法院应当受理。
2、当事人有权选择行政诉讼或者行政复议，但是一旦当事人选择了行政复议，行政复议决定即为发生法律效力的终局决定，当事人将因选择复议丧失提起诉讼的权利。对终局行政行为，只有全国人大及其常委会制定的法律才有权规定。
3、当事人对具体行政行为不服，必须先申请复议，对复议不服的才可向人民法院起诉，否则人民法院不予受理。