依据我国相关法律的规定，仲裁庭有权确认合同的效力，所以仲裁是可以确认合同无效的，并且仲裁协议是独立存在的，合同就更不影响仲裁协议的效力。
二、相关法律规定
《中华人民共和国仲裁法》
第十七条 有下列情形之一的，仲裁协议无效:
(一)约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围的;
(二)无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议;
(三)一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的。
第十八条 仲裁协议对仲裁事项或者仲裁委员会没有约定或者约定不明确的，当事人可以补充协议;达不成补充协议的，仲裁协议无效。
第十九条 仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁协议的效力。
仲裁庭有权确认合同的效力。
1、一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益。所谓欺诈，就是故意隐瞒真实情况或者故意告知对方虚假情况欺骗对方，目的是使其作出错误的意思表示而与之订立合同。如以次充好、以假充 真，利用托儿共同欺骗他人，假扮订立合同骗取对方的定金、预付款。构成欺诈要有一方有欺诈的故意，实施了欺诈的行为，受欺诈方签订合同是受欺诈的结果 等要件。
2、恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益的行为。即双方当事人互相勾结，为牟取非法利益，共同订立损害国家、集体或者第三人利益的合同。如以低价变卖国有资产，代理人与第三人串通损害被代理人利益等。
3、以合法形式掩盖非法目的。指当事人订立合同在形式上是合法的，但在目的和内容上是非法的。如名为联营、实为借贷的合同，名为借贷、实为非法集资的合同，名为分包、实为转包的合同，为逃避债务而转移资产的合同。
4、损害社会公共利益的合同。也就是违反公序良俗的合同，它违反了社会公共道德，破坏了社会经济秩序和生活秩序。如提供场地给他人进行淫秽表演、聚众赌博、卖淫嫖娼等活动。
5、违反法律、行政法规的强制性规定的合同。法律是指由全国人大及其常委会制定的法律，行政法规是指由国务院颁布的法规。强制性规定是指法律、行政法规中规定人们必须为某些行为或不得为某些行为，如违法转让探矿权、采矿权的合同，非法买卖麻醉药品的合同。
6、格式条款和免责条款。提供格式条款的一方免除其责任、加重对方责任、排除对方主要权利的，该条款无效。