依据我国相关法律的规定，女职工怀孕后紧急辞工的，如果用人单位扣工资的，是属于劳动争议，女职工可申请或者仲裁解决纠纷。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》
第二条 中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：
(一)因确认劳动关系发生的争议;
(二)因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议;
(三)因除名、辞退和辞职、离职发生的争议;
(四)因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议;
(五)因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议;
(六)法律、法规规定的其他劳动争议。
第九条 用人单位违反国家规定，拖欠或者未足额支付劳动报酬，或者拖欠工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金的，劳动者可以向劳动行政部门投诉，劳动行政部门应当依法处理。
按规定，公司不得随意解除怀孕女员工，女员工在孕期、产期、哺乳期内，劳动合同期限届满时，公司应当将劳动合同的期限顺延至孕期、产期、哺乳期期满为止。
如果公司违规辞退女员工，将要支付相应的赔偿金。并且，支付赔偿金时是按照以下的标准二倍：
1、按员工在本公司工作的年限;
2、每满一年向员工支付一个月工资;
3、工作六个月以上不满一年的按一年计算;
4、不满六个月的向员工支付半个月工资的经济补偿。
注意，这里的月工资是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
不过，公司不知情的情况下辞退怀孕女员工，可以按以下处理：
1、公司应该恢复跟员工的劳动关系;
2、续签劳动合同至哺乳期结束;
3、接受赔偿金的，需要退还给公司。
另外，女员工被公司辞退后，可以选择要求公司继续履行劳动合同，还是按要求支付赔偿金，这点不受限制。